Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms