Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USPL1Q5W0Q7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms