Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms