Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
RNF220Q5VTB9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF220Q5VTB9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms