Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf60Q5U649 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms