Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC122Q5T0U0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms