Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF3Q5SZQ8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CELF3Q5SZQ8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms