Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAT1Q5SQI0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAT1Q5SQI0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms