Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms