Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms