Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN4Q5BKX8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms