Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HSP90AA4PQ58FG1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms