Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBK1Q52WX2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBK1Q52WX2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms