Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAN2Q504Q3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAN2Q504Q3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms