Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC1Q4VXA5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms