Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms