Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N0

GGTA1P, Inactive N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1PQ4G0N0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GGTA1PQ4G0N0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GGTA1PQ4G0N0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms