Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD55Q3KP44 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms