Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms