Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM71Q2Q1W2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms