Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDO1Q16878 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms