Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRNQ16849 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRNQ16849 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRNQ16849 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTPRNQ16849 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTPRNQ16849 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTPRNQ16849 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PTPRNQ16849 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PTPRNQ16849 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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PTPRNQ16849 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PTPRNQ16849 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTPRNQ16849 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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PTPRNQ16849 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRNQ16849 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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