Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHQ16836 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHQ16836 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHQ16836 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHQ16836 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHQ16836 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHQ16836 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHQ16836 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHQ16836 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHQ16836 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHQ16836 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHQ16836 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHQ16836 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHQ16836 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHQ16836 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHQ16836 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHQ16836 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHQ16836 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHQ16836 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHQ16836 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHQ16836 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHQ16836 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHQ16836 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHQ16836 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHQ16836 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHQ16836 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHQ16836 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHQ16836 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHQ16836 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHQ16836 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHQ16836 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHQ16836 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HADHQ16836 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms