Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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