Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACKR1Q16570 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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