Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ZNF56Q15929 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ZNF56Q15929 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ZNF56Q15929 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ZNF56Q15929 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ZNF56Q15929 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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ZNF56Q15929 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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ZNF56Q15929 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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ZNF56Q15929 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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