Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRK1Q15835 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRK1Q15835 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms