Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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