Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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