Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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