Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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SEC23BQ15437 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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SEC23BQ15437 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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SEC23BQ15437 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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