Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
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