Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPAQ15257 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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