Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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