Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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