Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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