Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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GBX1Q14549 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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GBX1Q14549 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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GBX1Q14549 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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GBX1Q14549 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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GBX1Q14549 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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GBX1Q14549 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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GBX1Q14549 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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GBX1Q14549 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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GBX1Q14549 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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GBX1Q14549 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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GBX1Q14549 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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