Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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