Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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