Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT1Q14517 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms