Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB33AQ14088 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB33AQ14088 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms