Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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COL9A2Q14055 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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COL9A2Q14055 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
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COL9A2Q14055 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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