Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC3Q14003 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC3Q14003 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms