Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2H2Q13888 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms