Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ALCAMQ13740 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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