Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms