Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
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PAPPAQ13219 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAPPAQ13219 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAPPAQ13219 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAPPAQ13219 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAPPAQ13219 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
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PAPPAQ13219 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
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PAPPAQ13219 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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PAPPAQ13219 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAPPAQ13219 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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PAPPAQ13219 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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PAPPAQ13219 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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PAPPAQ13219 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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PAPPAQ13219 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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PAPPAQ13219 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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PAPPAQ13219 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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PAPPAQ13219 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
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PAPPAQ13219 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
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