Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP4Q13115 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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