Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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