Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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